Menu Nástroje obsahuje nabídku Možností Internetu. Pro nastavení bezpečné práce prohlížeče MSIE jsou důležité karty Zabezpečení a Osobní údaje.

Karta Zabezpečení nastavuje zejména úroveň bezpečnostních zón, karta Osobní údaje pak manipulaci s malými soubory (cookie), které zapisují do PC navštívené weby. Podrobnosti viz dále.