Fragmentace je  rozptýlení jednotlivých částí diskového souboru na různá místa disku a vzniká při odstraňování starých souborů a přidávání souborů nových. Například, když se nový soubor nevejde do momentálně největší volné a souvislé části disku. Pak musí být rozdělen na části a zapsán do několika volných míst disku. To zpomaluje přístup k souboru. Při každém otevření souboru je totiž nutné vyhledat na disku všechny části souboru.

Defragmentace je proces přepisování diskového souboru, který je na disku rozptýlen, do souvislého prostoru. Cílem je zrychlení přístupu k souboru.