Certifikáty mohou být  kvalifikované, komerční nebo testovací.

Kvalifikovaný certifikát je certifikát, který splňuje všechny požadavky ze zákona o elektronickém podpisu. Je využíván především „orgány veřejné moci“ (například státní orgány

a orgány územní samosprávy) při vzájemné elektronické komunikaci a při elektronické komunikaci s fyzickými

a právnickými osobami. Tak například, když  posíláme nějaký

e-mail úřadu, je třeba ho podepsat zaručeným elektronickým podpisem doprovázeným kvalifikovaným certifikátem.

Kvalifikované certifikáty vydávají akreditovaní poskytovatelé certifikačních služeb. V současné době u nás mají tuto akreditaci tři CA:

1.      První certifikační autorita – http://www.ica.cz;

2.      PostSignum QCA - http://qca.postsignum.cz;

3.      eIdentity - http://www.eidentity.cz.